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zotero基础操作和主要功能

Zotero是一款开源的文献管理软件,管理文献信息(如作者、标题、出版社、摘要、阅读笔记等)及相关材料(如PDF文件等)。在使用Linux之前,Endnote作为一款非常流行的知识管理软件,功能已经非常强大,可以满足windows用户需求。但Endnote跨平台和实时同步体验不够好,没有标签功能,非开源,过于臃肿等。类似的文献管理软件还有许多,也有一些可以跨平台同步使用,但使用了Zotero之后,发现所有需求都已经满足,不需要再学习别的工具了。

读音和含义

Zotero读音为/zoʊˈtɛroʊ/,源于阿尔巴尼亚语zotëroj,意思是to master

安装

到官网(https://www.zotero.org/) 下载相应操作系统的软件包,目前软件版本是5.0。Windows用户下载exe安装即可。Linux用户下载对应的32或者64位软件包,解压后在当前目录执行zotero可以启动软件,对于Ubuntu用户,可以使用下面的方法将图标添加到快速启动栏。

For Ubuntu, the tarball includes a .desktop file that can be used to add Zotero to the launcher. Move the extracted directory to a location of your choice (e.g., /opt/zotero), run the set_launcher_icon script from a terminal to update the .desktop file for that location, and symlink zotero.desktop into ~/.local/share/applications/ (e.g., ln -s /opt/zotero/zotero.desktop ~/.local/share/applications/zotero.desktop). Zotero should then appear either in your launcher or in the applications list when click the grid icon (“Show Applications”), from which you can drag it to the launcher.

之后,可在快速启动栏找到Zotero。

更多信息:https://www.zotero.org/support/installation

文献下载类插件

Zotero Connector

以Firefox为例,首先安装必备的Zotero Connector,它可以自动识别网页中的文献信息,并通过点击插件按钮保存在Zotero本地数据库。该功能对于谷歌学术、ScienceDirect、WOS、Wiley Online Library、Springer Link、IEEE数据库、Nature、Science等数据和期刊平台通用。它的基本原理是识别网页中的DOI号。

中文知网插件

Zotero Connector对于中文文献较为无力,因此Zotero的中文文献识别需要借助一个插件–Jasminum。下载地址为:https://github.com/l0o0/jasminum
基本功能有:

  • 拆分或合并 Zotero 中条目作者姓和名
  • 根据知网上下载的文献文件来抓取引用信息(就是根据文件名)
  • 添加中文PDF/CAJ时,自动拉取知网数据,该功能默认关闭。需要到设置中开启,注意添加的文件名需要含有中文,全英文没有效果(还是根据文件名)
  • 为知网的学位论文 PDF 添加书签
  • 更新中文 translators
  • 拉取文献引用次数,是否核心期刊

如果浏览器登录了CNKI,并有下载权限,则Zotero可自动下载知网文献,若无下载权限,则仅保存文献信息。

该插件还有一个常用功能是把手动下载的知网文献拖入Zotero,然后右键提取知网文献信息,即可自动完成文献信息的抓取。

PDF文献也自动归到该文献目录下

SCI-hub的接入

很多时候,我们没有各大数据库的下载权限,Zotero Connector只能抓取文献信息,不能下载文献。这时可以将Zotero和SCI-hub联合起来,达到几乎全能的下载效果。我们打开Zotero的首选项,进入Advanced-->Config Editor

搜索extensions.zotero.findPDFs.resolvers,双击编辑,删除[],并将以下代码粘贴进去:

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{
"name":"Sci-Hub",
"method":"GET",
"url":"https://sci-hub.se/{doi}",
"mode":"html",
"selector":"#pdf",
"attribute":"src",
"automatic":true
}

选中单篇或者多篇文献,手动点击右键菜单中的Find Available PDF,会弹出单独的窗口显示下载进度。但SCI-hub对新文献收录较慢,新文献无法下载。这时,我们只需要淘宝10元包年或者15元永久账号就行了。

写作类插件

word 插件

Zotero自动在windows平台上安装了Word Processor Plugins,可以从Tools → Add-ons查看。

You can reinstall the plugins later from the Cite → Word Processor Plugins pane of the Zotero preferences. If you’re having trouble, see Manually Installing the Zotero Word Processor Plugin or Word Processor Plugin Troubleshooting.
If you previously installed the Firefox versions of the word processor plugins into Zotero 5.0 or Zotero Standalone 4.0, you should uninstall them from Tools → Add-ons.

更多信息:https://www.zotero.org/support/word_processor_plugin_installation

LibreOffice 插件

在linux系统下,Zotero支持LibreOffice插件,安装和使用类似Word。另外,Zotero对WPS的支持不是很好,虽然有,但是缺少维护,现在不能用了。

写作

word

一般由于安装了word插件,word界面将中自动显示zotero按钮,可以直接使用。点击Add /Edit Citation,弹出第一个对话框,选择一个期刊要求的文献引用格式,如中文常用的GB/T7714-1987。如果系统没带想要的期刊文献格式,可以通过右下角的Manage Styles查找,一般期刊都可快速找到。

确认后,将弹出一个输入框,这里和Endnote明显不同,Zotero的插入是需要手动输入一些单词进行搜索提示,比如输入zotero这个单词,系统自动显示数据库的文献。使用技巧是输入文献作者姓名加年份或者标题关键词,熟练之后发现这样也挺好。

然后,点击Add/Edit Bibliography,插入参考文献。效果为:

latex

overleaf在线编辑为例。首先使用Zotero将需要的文献归类到一个目录,右键Export collection,导出bibTex文件。将bib文件上传到overleaf项目目录,进一步使用latex语法\cite插入文献即可。

overleaf会根据输入的单词(通常是作者姓氏)自动搜索bib文件中的文献。

由于期刊通常提供latex模板,这也包含了引文格式模板,因此用户不需要关心引文格式。

文献跨平台同步

坚果云

坚果云是一款办公云存储和同步系统。坚果云和zotero的搭配可以实现多个电脑之间(包括夸操作系统)的文献同步。这方便的教程网上已有很多,不再赘述。

需要注意的是,有时候重装系统后,数据库全部丢失,需要从云端重新下载。这时zotero的Data SyncingFile Syncing将发挥重要作用。我们无需手动copy,只要输入正确的云端地址,点击同步即可得到之前一模一样的数据库。这里不建议使用Data Syncing下面的Sync full-text content,可能和下面的File Syncing重复更新,增加流量消耗。

Endnote 转入

Endnote用户尝试Zotero的第一步也是将Endnote数据库导入到Zotero中,这方面的教程也非常多,基本可以无缝导入了,包括文献文件。可参考:https://www.bilibili.com/read/cv7160554

Feeds

FeedsRSS更新订阅,一般的大点的期刊提供该功能,如JGR、Nature等。

Feeds are a great way to discover new research. With feeds, you can subscribe to updates from a journal, website, publisher, institution, research group, or other source and quickly find new articles or works. If you find an item in a publication’s feed that you want to save and read further, you can add it to your Zotero library with the click of a button.

以Nature为例,官网右上角点击RSS feed,复制浏览器网址http://feeds.nature.com/nature/rss/current

回到Zotero,按下面操作添加即可。

文献查重

Duplicate Items功能可以通过文献doi等信息,查找数据库中的重复文献,进一步可以合并同类文献,是数据库简洁无重复。

我的文献

My publications可以集中保存管理自己发表的文献,这些文献也可以存在于其他文献集。哦,Zotero中任一个文献都可以存在于任意文献集(目录),通过按住Ctrl+点击文献,可以显示文献保存在那些文献目录中(显示黄色)。

本文仅列举一些常用的操作,Zotero的功能还有很多,网上也有非常多的学习教程。但对于一般用户来说,这些足够了。

综上,我们可以看到Zotero构建的不仅是文献管理生态,更是一个知识生态,期待大家可以利用好这个科研利器。